토모큐브

• 주력 제품인 홀로토모그래피 현미경(HT 시리즈) 장비 판매가 매출의 핵심이며, 연구기관, 대학, 제약사 등을 대상으로 한다. 고가의 플래그십 모델부터 보급형 라인업까지 갖추어 다양한 고객 수요에 대응하고 있으며, 특히 북미와 유럽 시장에서 직판 및 대리점 채널을 통해 수출 비중을 높여가고 있다.

• 단순 장비 판매를 넘어, 3D 세포 영상 데이터를 분석하고 관리하는 자체 소프트웨어 'TomoAnalysis'를 제공하며 플랫폼 비즈니스로의 전환을 꾀하고 있다. 향후 AI 분석 기능이 고도화된 소프트웨어를 구독 모델로 제공하여, 하드웨어 판매 이후에도 지속적인 수익을 창출하는 것을 목표로 한다.

• 바이오 분야에서 축적한 비파괴 3차원 측정 기술을 활용해 반도체, 디스플레이 등 산업용 검사 장비 시장으로 사업을 다각화하고 있다. 웨이퍼 내부 크랙이나 글래스 기판을 손상 없이 검사하는 솔루션을 통해 새로운 고마진 수익원을 확보하려는 전략이다.

• 세포를 관찰하는 현미경 시장은 전통적으로 형광 염색 방식이 주류를 이루었으나, 이 방식은 염색 과정에서 세포가 손상되거나 죽을 수 있는 치명적인 단점이 존재했다. 살아있는 세포의 자연스러운 활동을 실시간으로 보는 것은 연구자들의 오랜 숙원이었다.

• 토모큐브의 홀로토모그래피 기술은 염색 과정 없이(Label-free) 빛의 굴절률 차이를 이용해 세포 내부 구조까지 3D로 시각화하여 이런 한계를 극복했다. 이는 신약 개발 과정에서 약물에 대한 세포 반응을 실시간으로 추적하거나, 세포치료제의 품질을 관리하는 등 다양한 바이오 연구 분야에서 새로운 가능성을 열고 있다.

• 최근 미국 FDA가 동물실험을 단계적으로 폐지하고 오가노이드(장기유사체)를 핵심 대체 기술로 제시하면서, 두꺼운 3차원 구조의 오가노이드를 손상 없이 내부까지 분석할 수 있는 토모큐브의 기술이 독점적인 대안으로 떠오르고 있다.

세포의 민낯을 보고 싶어 하는 연구자들에게 토모큐브의 현미경은 '고성능 민낯 관찰캠'과도 같다. 기존 방식이 두꺼운 화장(형광 염색)을 하거나 심지어 박제(고정)를 해야만 겨우 세포의 일부를 볼 수 있었다면, 토모큐브는 살아있는 세포가 핵분열하고 소기관을 움직이는 모습을 3D 영상으로 생생하게 보여준다. 덕분에 MIT, 존스 홉킨스 같은 세계적인 '덕후'들이 먼저 알아보고 사용하며 입소문을 탔다.

창업자인 박용근 대표는 KAIST 물리학과 교수로, 이 기술을 최초로 개발한 스위스 기업보다 5년이나 앞선 기술력을 확보하며 청출어람이 무엇인지 제대로 보여줬다. 최대 해상도는 더 정밀하고, 관찰 가능한 샘플 두께는 훨씬 두꺼워 기술적 격차를 확실히 벌렸다는 평가다. 단순히 제품만 파는 게 아니라, AI를 결합해 영상 분석까지 해주는 통합 솔루션을 제공하는 것도 강점이다.

재생의학이나 신약 개발 분야에서 이 기술의 가치는 더욱 빛난다. 특히 미니 장기인 오가노이드를 분석하는 데는 사실상 대체재가 없는 수준으로 평가받는다. 동물실험이 점차 사라지는 추세 속에서, 토모큐브의 현미경은 미래 바이오 연구의 필수 장비, 즉 '인싸템'으로 자리 잡을 가능성이 매우 높다.

토모큐브의 야망은 바이오 연구실에만 머무르지 않는다. "세포도 3D로 보는데, 반도체 웨이퍼 속은 왜 못 보겠어?"라는 이과 감성 충만한 발상으로 산업용 검사 장비 시장에 출사표를 던졌다. 세포를 손상시키지 않고 내부를 들여다보던 비파괴 검사 기술이 반도체 후공정이나 디스플레이 패널 검사에도 딱 들어맞았던 것이다.

기존 검사 장비들이 웨이퍼를 잘라봐야만 알 수 있던 내부의 미세한 결함이나, 하이브리드 본딩의 정렬 상태를 겉면에 손상 없이 꿰뚫어 볼 수 있게 됐다. 이는 수율에 목숨 거는 반도체 업계에는 가뭄의 단비 같은 소식. 고마진이 기대되는 산업용 장비 시장 진출은 회사의 수익 구조를 다각화하고 안정성을 높이는 신의 한 수가 될 수 있다.

2025년 첫 산업용 수주에 성공하며 가능성을 입증했고, 현재는 본격적인 상업화를 위해 글로벌 반도체 장비 업체들과 논의를 진행 중인 것으로 알려졌다. 바이오 분야에서 갈고 닦은 '투시력'이 첨단 산업의 심장부까지 파고들며, 단순한 바이오 벤처가 아닌 차세대 융합 계측 플랫폼 기업으로의 변신을 예고하고 있다.

• [기대] 미국 FDA의 동물실험 단계적 폐지 선언과 맞물려 오가노이드 기반의 신약 개발 시장이 개화하면서, 살아있는 세포를 3D로 관찰할 수 있는 토모큐브의 홀로토모그래피(HT) 기술이 사실상 대체 불가능한 표준 분석법으로 자리매김할 것이라는 기대감이 커지고 있다. 특히 글로벌 빅파마와의 공동 연구를 통해 기술의 신뢰도를 확보하고, 이를 바탕으로 고가의 장비 및 AI 소프트웨어 구독 모델을 확산시켜 나갈 로드맵이 명확하다는 점이 긍정적이다.

• [기대] 바이오 시장뿐만 아니라 반도체, 디스플레이 등 고정밀 산업용 3D 계측 시장으로 사업 영역을 성공적으로 다각화하고 있다는 점이 주요 투자 포인트로 꼽힌다. 기존의 파괴적인 검사 방식을 대체하는 비파괴 검사 기술의 이점을 살려 유리기판, 하이브리드 본딩 등 차세대 공정의 핵심 검사 솔루션으로 채택될 경우, 바이오 부문과 함께 가파른 성장을 이끌 쌍두마차가 될 수 있다.

• [우려] 2024년 11월 상장 이후 벤처캐피탈(VC) 등 재무적 투자자들의 지분 매각 가능성, 즉 오버행 리스크가 단기적인 주가 변동성의 주된 요인으로 지적된다. 상장 전 시리즈 A, B 투자에 참여했던 VC들의 보유 물량이 의무보유확약 기간 종료 이후 시장에 출회될 경우, 주가에 부담으로 작용할 수 있다는 분석이다.

2025년 4분기

• 매출액 50억 원, 영업이익 4억 원을 기록하며 시장의 기대를 뛰어넘는 '어닝 서프라이즈'를 달성했고, 창사 이래 첫 분기 흑자 전환에 성공했다. 이는 저가형 신제품 'HT-X1 mini'의 국내 시장 침투가 본격화되고, 비바이오 산업용 모듈 매출이 더해진 결과로 분석된다.

• 당초 증권가에서는 매출액 40억 원, 영업손실 6억 원을 추정했으나, 실제 실적은 이를 크게 상회하며 회사의 성장 스토리가 구체적인 숫자로 증명되기 시작했다는 평가를 받았다.

• 2025년 연간 매출액은 113억 원으로 전년 대비 약 90% 이상 성장했으며, 이러한 성장세에 힘입어 2026년에는 연간 흑자 전환(BEP 달성)이 유력시되고 있다.

2025년 3분기

• 2025년 11월 14일 발표된 3분기 실적은 매출 25억 원, 주당순이익(EPS) -116원을 기록했다.

• 매출은 꾸준히 성장하는 모습을 보였으나, 아직은 연구개발 및 글로벌 영업망 확대에 따른 비용 지출로 인해 영업적자가 지속되는 구간에 있었다.

• 이 시기부터 가성비 모델 'HT-X1 mini'를 출시하고 본격적인 마케팅에 돌입하며 4분기 실적 개선의 발판을 마련했다.

2025년 2분기

• 2025년 8월 14일 발표된 2분기 실적은 매출 31.4억 원, 주당순이익(EPS) -86원을 기록했다.

• 고가의 'HT-X1 Plus' 장비를 중심으로 미국과 유럽 등 선진국 시장에서 꾸준한 매출이 발생하며 기술력을 인정받기 시작했다.

• 상반기 누적 매출이 38억 원을 넘어서며, 연간 매출 100억 원 돌파에 대한 기대감을 높였다.

2025년 1분기

• 2025년 5월 15일 발표된 1분기 실적은 매출 6.5억 원, 주당순이익(EPS) -866원을 기록했다.

• 전통적인 비수기임에도 불구하고, 전 세계 50개국 200여 개 연구기관에 장비를 공급하며 안정적인 수출 실적을 이어갔다.

• 1분기 말 기준, 전체 매출의 약 93%가 수출에서 발생하며 글로벌 시장에서의 높은 경쟁력을 입증했다.

최근 주주 구성

• 박용근(17.63%): 카이스트 물리학과 교수로, 토모큐브의 공동 창업자이자 대표이사다. 홀로토모그래피 분야의 세계적인 석학으로 회사의 기술 개발을 총괄하고 있다.

• 홍기현(지분율 특수관계인 합산): 공동 창업자이자 특수관계인으로, 최대주주인 박용근 대표와 함께 초기부터 회사를 이끌어 온 핵심 인물이다.

• 최대주주 및 특수관계인(33.31%): 박용근 대표이사를 포함한 공동 창업주 등 특수관계인의 합산 지분율로, 비교적 안정적인 경영권을 확보하고 있다.

• 인터베스트 외 4인(12.83%): 상장 전 투자에 참여한 국내 주요 벤처캐피탈(VC) 중 하나로, 초기 성장 단계부터 회사의 잠재력을 높이 평가하여 투자했다.

• 한미사이언스 외 3인(6.47%): 국내 유력 제약 그룹사 등으로, 토모큐브의 기술이 신약 개발 분야에서 활용될 가능성을 보고 전략적 투자를 단행한 것으로 보인다.

지분 변동 히스토리

• 2024년 11월, 기술특례 제도를 통해 코스닥 시장에 성공적으로 상장하며 대규모 자금을 조달하고 일반 주주들에게 주식이 공개되었다.

• 상장 이전에는 블루포인트파트너스의 초기 투자를 시작으로 소프트뱅크벤처스(SBVA), 인터베스트, 컴퍼니케이파트너스 등 다수의 유력 벤처캐피탈로부터 총 442억 원 규모의 시리즈 투자를 유치하며 성장의 발판을 마련했다.

• 상장 후 1개월, 3개월 단위로 주요 투자자들의 의무보유확약 물량이 해제되면서 시장에서 유통 가능한 주식 수가 점진적으로 증가했다.

• 토모큐브는 현재 사업 보고서 및 공식 자료상으로 특기할 만한 주요 종속회사나 계열사를 두고 있지 않으며, 홀로토모그래피 기술 개발, 제품 생산 및 판매, AI 소프트웨어 개발 등 핵심 사업을 모두 본사에서 직접 영위하고 있다. 사업의 수직계열화가 내부적으로 이루어지는 구조로, 하드웨어 설계부터 소프트웨어, AI 개발까지 포괄적인 역량을 내재화하고 있는 것이 특징이다.

• [협력] 글로벌 빅파마 'R'사와 AI 기반 오가노이드 분석 기법을 공동 개발하고 있으며, 2026년 3분기 결과 발표를 목표로 하고 있다. 이 프로젝트가 성공적으로 마무리되면 해당 제약사의 표준 분석법으로 채택되어 장비와 소프트웨어의 대규모 공급으로 이어질 수 있는 중요한 협력 관계다.

• [경쟁] 전통적인 현미경 시장의 강자인 칼 자이스, 라이카 등과 간접적인 경쟁 관계에 있으며, 홀로토모그래피 원천 기술을 보유한 스위스의 Nanolive사와는 직접적인 경쟁 구도를 형성하고 있다. 다만 토모큐브는 측정 가능 깊이 등 기술적인 측면에서 경쟁사 대비 우위를 점하고 있다는 평가를 받는다.

• [공급] 국내 OLED 검사장비 업체에 HT 모듈을 공급하는 계약을 체결했으며, 다수의 글로벌 반도체 및 디스플레이 소재/장비 기업들과 하이브리드 본딩, 유리기판 검사 분야에서 기술검증(PoC) 및 파일럿 프로젝트를 진행하며 산업용 시장으로의 보폭을 넓히고 있다.

• 2026.02.09 2025년 4분기 실적 발표. 매출 50억, 영업이익 4억 원으로 시장 전망치를 크게 상회하며 분기 첫 흑자 전환 달성.

• 2025.12.03 AI 기반 3D 이미지 분석 소프트웨어 'TomoAnalysis'의 기능 업데이트 발표. 딥러닝 기반의 자동 분석 기능 강화.

• 2025.09.15 보급형 신제품 'HT-X1 mini' 출시. 기존 고가 장비 시장과 더불어 중저가 시장까지 공략하며 고객층 다변화 전략 개시.

• 2025.04.17 미국 FDA, 신약 개발 시 동물실험 단계적 폐지 계획 공식 발표. 토모큐브의 오가노이드 분석 기술이 핵심 수혜 기술로 부각.

• 2024.11.21 코스닥 시장 신규 상장. 기술특례 상장 제도를 통해 증시에 입성하며 본격적인 성장기 돌입.